烟草种子能否萌发，与种子的形态结构、休眠、寿命以及外界环境条件中的水分、温度、氧气、光照等因素有密切的关系。而光照可以有光照箱提供，因为人工气候培养箱一种能够自由设定气候，最大程度模拟温湿度光照等气候的农业仪器。从种子萌发的内因来看，种子结构对其萌发的影响最大，可以说完整的结构是种子萌发的物质基础。

     烟草种子看起来体积很小。普通烟草（如烤烟、香料烟、白肋烟等）的种子长约0.65～0.80mm，宽约0.45～0.55mm，黄花烟草的种子虽然比普通烟草的种子大，但它的重量也只不过是普通烟草种子重量的3倍。与小麦、玉米、大豆等一些作物的大粒种子相比，其体内所含的营养物质也必然少，由于烟草种子体积小的限制，增加了其萌发的难度。因此，在做烟草种子的发芽实验时，我们需要先对烟草种子进行品质鉴定，其中包括种子千粒重、种子发芽率、种子净度分析等参数测定。其中种子吹风机是经常使用到的仪器。种子吹风机采用的原理为微粒在空气中的漂浮速度不同而来区分不同种类的种子，这是净度分析前的基础性操作，而种子吹风机有时也会被叫做种子风选仪。只有当满足一定品质要求的种子，才能进行种子发芽测试。

     将烟草种子放到放大镜下观察，种子的表面有象核桃纹似的波状花纹，这些花纹是由种脐处发出的种脉构成，靠近种脐处和腹面的花纹密而且窄，其它部位的花纹稍稀疏。这些花纹的存在，增大了种子的表面积，使种子表面吸附水分的能力增强，当把种子浸湿后，易被一层水膜包起来，阻碍了空气透入种子内部，造成种子萌发时缺氧。烟草种子的这种特殊的表面结构也导致了种子难以萌发。